10 anos atrás, a Caixa de Pandora descoberta em Marte foi trazida, e com ela, uma catástrofe que mudaria o futuro do Japão drasticamente. Nos anos seguintes, o Incidente da Muralha Celestial, que dividiu o país em três territórios: Touto, Seito e Hokuto. Nesse momento, monstros não-identificados chamados de Smash começaram a surgir. Para combater esse caos, o governo de Touto pede a ajuda de Sento Kiryu, um físico gênio, para desvendar os segredos dos Smashs e da Caixa de Pandora.